Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP69A5D8W1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP69A5D8W1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP69A5D8W1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms