Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFLP07196 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFLP07196 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms