Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC82Q8N4S0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC82Q8N4S0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms