Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAD1O00515 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAD1O00515 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAD1O00515 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAD1O00515 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAD1O00515 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAD1O00515 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms