Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms