Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB2P55268 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms