Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEST4Q8NFU0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms