Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms