Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFLP07196 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFLP07196 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFLP07196 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFLP07196 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms