Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCTD3Q9Y597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD3Q9Y597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCTD3Q9Y597 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCTD3Q9Y597 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD3Q9Y597 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCTD3Q9Y597 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms