Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HCN4Q9Y3Q4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HCN4Q9Y3Q4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCN4Q9Y3Q4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCN4Q9Y3Q4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCN4Q9Y3Q4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HCN4Q9Y3Q4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms