Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
SHROOM4Q9ULL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
SHROOM4Q9ULL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC50.13■■■■■ 5.62
SHROOM4Q9ULL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC50.08■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.08■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
SHROOM4Q9ULL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
SHROOM4Q9ULL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
SHROOM4Q9ULL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
SHROOM4Q9ULL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
SHROOM4Q9ULL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
SHROOM4Q9ULL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC49.97■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC49.95■■■■■ 5.59
SHROOM4Q9ULL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC49.94■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.88■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
SHROOM4Q9ULL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC49.84■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
SHROOM4Q9ULL8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC49.8■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC49.76■■■■■ 5.56
SHROOM4Q9ULL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC49.75■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC49.74■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC49.7■■■■■ 5.55
SHROOM4Q9ULL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC49.68■■■■■ 5.54
SHROOM4Q9ULL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
SHROOM4Q9ULL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
SHROOM4Q9ULL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
SHROOM4Q9ULL8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC49.62■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC49.62■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC49.61■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
SHROOM4Q9ULL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.55■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
SHROOM4Q9ULL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC49.51■■■■■ 5.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms