Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL3Q9UKT7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL3Q9UKT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXL3Q9UKT7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXL3Q9UKT7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXL3Q9UKT7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXL3Q9UKT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms