Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPS1Q9UHF7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRPS1Q9UHF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPS1Q9UHF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPS1Q9UHF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPS1Q9UHF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms