Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNAL1Q9UBT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNAL1Q9UBT7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms