Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CGNQ9P2M7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNQ9P2M7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CGNQ9P2M7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CGNQ9P2M7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms