Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDE1Q9NZC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDE1Q9NZC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDE1Q9NZC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDE1Q9NZC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDE1Q9NZC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDE1Q9NZC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
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