Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA2D2Q9NY47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA2D2Q9NY47 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D2Q9NY47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms