Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW75

GPATCH2, G patch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2Q9NW75 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPATCH2Q9NW75 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPATCH2Q9NW75 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPATCH2Q9NW75 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPATCH2Q9NW75 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPATCH2Q9NW75 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPATCH2Q9NW75 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPATCH2Q9NW75 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPATCH2Q9NW75 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPATCH2Q9NW75 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms