Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP3Q9NQ35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP3Q9NQ35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP3Q9NQ35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms