Protein–RNA interactions for Protein: Q9H977

WDR54, WD repeat-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54Q9H977 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR54Q9H977 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR54Q9H977 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR54Q9H977 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR54Q9H977 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR54Q9H977 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR54Q9H977 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR54Q9H977 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR54Q9H977 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR54Q9H977 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR54Q9H977 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms