Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMDAQ9H2I8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRMDAQ9H2I8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRMDAQ9H2I8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRMDAQ9H2I8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRMDAQ9H2I8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms