Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ9H0N0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ9H0N0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ9H0N0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ9H0N0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ9H0N0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ9H0N0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms