Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRTNQ9H040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPRTNQ9H040 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPRTNQ9H040 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRTNQ9H040 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRTNQ9H040 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms