Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHE41Q9C0J9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHE41Q9C0J9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHE41Q9C0J9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms