Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80BQ9C086 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INO80BQ9C086 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80BQ9C086 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80BQ9C086 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INO80BQ9C086 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.4 ms