Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SYCP2Q9BX26 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SYCP2Q9BX26 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SYCP2Q9BX26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SYCP2Q9BX26 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SYCP2Q9BX26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
SYCP2Q9BX26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SYCP2Q9BX26 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SYCP2Q9BX26 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SYCP2Q9BX26 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SYCP2Q9BX26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
SYCP2Q9BX26 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SYCP2Q9BX26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYCP2Q9BX26 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SYCP2Q9BX26 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYCP2Q9BX26 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms