Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS4Q9BRT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS4Q9BRT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS4Q9BRT9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS4Q9BRT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.6 ms