Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LITAFQ99732 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LITAFQ99732 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms