Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PANX1Q96RD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PANX1Q96RD7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PANX1Q96RD7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PANX1Q96RD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms