Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMD8Q96LT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD8Q96LT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD8Q96LT4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD8Q96LT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms