Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PHACTR3Q96KR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PHACTR3Q96KR7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PHACTR3Q96KR7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PHACTR3Q96KR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHACTR3Q96KR7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHACTR3Q96KR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHACTR3Q96KR7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHACTR3Q96KR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHACTR3Q96KR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms