Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED3Q96IU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZBED3Q96IU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ZBED3Q96IU2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ZBED3Q96IU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZBED3Q96IU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZBED3Q96IU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZBED3Q96IU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZBED3Q96IU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED3Q96IU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBED3Q96IU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZBED3Q96IU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED3Q96IU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZBED3Q96IU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBED3Q96IU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
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