Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDCA7LQ96GN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDCA7LQ96GN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDCA7LQ96GN5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDCA7LQ96GN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDCA7LQ96GN5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDCA7LQ96GN5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA7LQ96GN5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA7LQ96GN5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA7LQ96GN5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA7LQ96GN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA7LQ96GN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA7LQ96GN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms