Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C18orf8Q96DM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C18orf8Q96DM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C18orf8Q96DM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms