Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTSSAQ969W0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTSSAQ969W0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTSSAQ969W0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTSSAQ969W0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTSSAQ969W0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTSSAQ969W0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms