Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2FQ969M7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2FQ969M7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2FQ969M7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2FQ969M7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms