Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCSTNQ92542 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCSTNQ92542 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCSTNQ92542 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCSTNQ92542 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCSTNQ92542 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms