Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM171Q8WVE6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM171Q8WVE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM171Q8WVE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM171Q8WVE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms