Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVIPQ8NHG7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SVIPQ8NHG7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms