Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGF0

OR52B6, Olfactory receptor 52B6, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR52B6Q8NGF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OR52B6Q8NGF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OR52B6Q8NGF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OR52B6Q8NGF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OR52B6Q8NGF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OR52B6Q8NGF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms