Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV3Q8NET8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPV3Q8NET8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPV3Q8NET8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV3Q8NET8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV3Q8NET8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV3Q8NET8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms