Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACVR1CQ8NER5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACVR1CQ8NER5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACVR1CQ8NER5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR1CQ8NER5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms