Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST4Q8NCG5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST4Q8NCG5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST4Q8NCG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST4Q8NCG5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms