Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC89Q8N998 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC89Q8N998 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC89Q8N998 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC89Q8N998 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms