Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SVBPQ8N300 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SVBPQ8N300 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVBPQ8N300 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVBPQ8N300 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms