Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RHOT1Q8IXI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOT1Q8IXI2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOT1Q8IXI2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOT1Q8IXI2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms