Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT9Q86SS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT9Q86SS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT9Q86SS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT9Q86SS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms