Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP1Q7L576 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP1Q7L576 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYFIP1Q7L576 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP1Q7L576 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYFIP1Q7L576 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP1Q7L576 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms