Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACS1Q6VY07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS1Q6VY07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACS1Q6VY07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PACS1Q6VY07 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACS1Q6VY07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms